肥厚型心肌病的并发症有：
(1)心律失常：这是常见的并发症，其中室性心律失常和心房颤动最为重要，需要治疗。
(2)心内膜炎发生率比较低，是由于血液中的细菌黏附在心脏内血流紊乱处，如主动脉瓣、二尖瓣等。
(3)心脏传导阻滞，可发生在窦房结和房室结，经常遇见到，也是影响药物治疗的因素。
(4)猝死：少数肥厚型心肌病患者会发生猝死，其前可能没有任何征兆。系统评价可能有助于识别这类高危患者
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