1.脑脓肿: 初期难鉴别, 可试验治疗，无效者可行活检。
2.带状疱疹病毒性脑炎: 胸腰部带状疱疹史、病情轻、预后好，以及CSF检出该病毒抗体，借此鉴别。
3.肠道病毒性脑炎: 夏秋多见、病初胃肠道症状，PCR(聚合酶链反应)检出CSF(脑脊液)中病毒DNA。
4.巨细胞病毒性脑炎:少见,常见于免疫缺陷如AIDS或长期应用免疫抑制剂患者，亚急性或慢性病程，体液见巨细胞、PCR(聚合酶链反应)检出CSF(脑脊液)中病毒DNA。
5.急性播散性脑脊髓炎:有感染或接种疫苗史, 脑和脊髓受损，出现相应体征。
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