膀胱结核也可表现为真性溃疡，常累及结核肾侧输尿管口周围，可有脓尿出现，尿检查可找到结核杆菌，泌尿系造影可显示肾结核的典型改变。寄生虫病引起的膀胱溃疡类似于间质性膀胱炎的表现，一般男性多发，根据尿中找到虫卵或典型的膀胱病理特征可作出诊断。而非特异性膀胱炎则很少有膀胱溃疡出现，尿中常见脓细胞及感染菌，抗生素治疗很效。
Utz和Zinke（1974年）发现他诊断的男性间质性膀胱炎有20％是癌肿，故强调必须进行活组织细胞学的检查。
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