对于起病较缓慢者应与原发性脑瘤鉴别，可借助于以上已述及的颅内转移瘤的特点、原发癌灶的发现、CT或MRI发现有多发性病灶存在，则颅内转移瘤的诊断可以确定。对于起病较快者应与脑脓肿作鉴别，通常脑脓肿患者多有明显的感染史，CT、MRI的表现亦各有不同，可借以区别。脑膜上的广泛转移应与脑膜炎相鉴别，前者无感染征象，却常有明显的精神症状;脑脊液蛋白含量增高，但通常细胞并不明显增高，中性粒细胞亦很少见到。
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