此病需与中枢神经系统损伤，脑膜炎等疾病相鉴别。
儿童会因大脑炎导致颅内压升高造成囟门突出(婴儿头顶骨未合缝的柔软的地方)。开始的症状类似感冒，如发热、头痛和呕吐，接下来嗜睡和颈部疼痛，特别是向前伸脖子时痛。小孩子经常因弓后背时感到疼痛。乙脑还会有暗红色或浅紫色淤点布满全身。结合病史可鉴别出是脑炎。
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