本病常被误诊为生殖器疱疹，生殖器疱疹在疱疹阶段出现多发性，成群生性水疱，检菌阴性，其次与硬下疳作鉴别时，需注意梅毒的硬下疳较硬，脓性分泌物少，无痛。以及除外其他急性外阴性溃疡等。
软下疳与硬下疳鉴别表 软下疳 硬下疳 潜伏期 2-3天 21天 数目 常多发 >5%单发 溃疡 基底软，表面污秽，分泌物多，脓性。 基底硬，表面尚清洁，分泌物少，浆液性。 疼痛 显著 无 局部淋巴结 肿大、软、痛、化脓、易破溃 肿大、硬、不痛、不化脓 病原体 杜克雷嗜血杆菌 梅毒螺旋体 梅毒血清学试验 阴性 阳性（感染6周后）
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